Celui-ci a rassemblé ses soldats de Mégara sur son météore géant, alors que le Capitaine Flam est enfermé dans les prisons de l'ancienne Mégara. Il prépare l'anéantissement de tous les terriens de la planète. Grace à l'intervention de ses amis à bord du Cyberlab, le Capitaine Flam sort heureusement de prison. Pour en savoir un peu plus sur le secret des civilisations de Mégara, le Capitaine Flam se rend dans une cité se trouvant dans une grotte
Les terriens retrouvent brutalement leurs anciennes caractéristiques d'hommes des cavernes à cause d'un complot commenté par l'empereur de l'espace. Le capitaine Flam et ses amis essaient de lutter contre ce tyran mais ils ne peuvent rien contre lui. Même lui passer à travers le corps ne lui fait aucun effet. Pour tenter de faire obstacle au plan du monstre, le capitaine Flam envoie MALA déguisé, sur la planète DENEF qui semble être l'endroit où se noue le complot. Mala est chargé de trouver les renseignements permettant de combattre l'empereur de l'espace.
Le gouvernement terrestre  fait appel au service de Curtis Newton alias le capitaine Flam, pour résoudre le mystère de la disparition de plusieurs cosmonautes. Le capitaine Flam s'embarque avec son équipe sur un vaisseau à destination de Denef, une planète au fin fond de l'univers. Là, il se trouve confronté à l'empereur de l'espace, le responsable du mal implacable qui frappe ceux qui osent lui résister, la rétrogradation de l'espèce.
A sa grande surprise,  il y découvre Keneth Lester, venu lui aussi chercher  le secret de Mégara. Le Capitaine Flam se retrouve une nouvelle fois prisonnier de l'empereur de l'espace. Grâce à Crag, il s'échappe et  arrête l'empereur avec  l'appareil fabriqué par le professeur Simon. Le Capitaine Flam réussira à convaincre les hommes de Denef afin de cesser l'attaque contre les terriens.
L'EMPEREUR DE L'ESPACE